המרכז להוגנות מגדרית בחינוך יזם והוביל מהלך פיתוח ומחקר בין ארגוני, שאפיין אמות מידה להוגנות מגדרית בשיח הכיתתי, פיתח כלים מעשיים למיפוי ההטיות בשיח ובחן פרקטיקות פדגוגיות יעילות לקידום הוגנות מגדרית בשיח. המהלך נעשה בשותפות עם היחידה למגדר ושוויון בין המינים במשרד החינוך והמרכז לשותפויות אקדמיה-שדה באוניברסיטת בן גוריון.
השיח בכיתה מהווה מרחב משמעותי ללמידה, ומחקרים רבים מצביעים על כך שהוא מושפע מאוד מהבניות מגדריות, כלומר שישנם הבדלים משמעותיים בין תלמידים לתלמידות בהיקף ההשתתפות בשיעור, בדרכים לקבלת רשות הדיבור ובאיכות ההשתתפות. כך למשל תלמידות משתתפות בשיח הכיתתי פחות מתלמידים, יותר שאלות הסבר והרחבה מופנות לתלמידים הבנים, והם נוטים להאריך את רשות הדיבור שלהם. עם זאת, התלמידים הבנים משתתפים פחות מתלמידות בשיח רגשי בכיתה ומקבלים פחות הזדמנויות לפתח מיומנויות של שיח רגשי.
ההטיות האלה בדרך כלל סמויות מן העין, מה שמנציח את קיומן ומשמר את הפערים המגדריים. כדי לשנות זאת צריך להתבונן על השיח הכיתתי במשקפיים מגדריים כדי לזהות את ההטיות, ולעודד השתתפות מגוונת בכיתה באמצעות כלים מעשיים. אנשי ונשות חינוך שידעו לזהות את ההטיות המגדריות בשיח הכיתתי, ויהיו להם את הכלים הפדגוגיים לצמצם את ההטיות הללו, יוכלו לפעול באופן מעשי להסרת חסמים מגדריים ולקידום שוויון הזדמנויות לתלמידים והתלמידות שלהם.